《少年派2》錢三一當初並不是故意把林妙妙一個人丟在機場的，他跟林妙妙之間發生了很深的誤會。只要錢三一一日不跟林妙妙解釋道歉，林妙妙就一日不可能真正原諒並且接受錢三一。《少年派2》錢三一什麼時候跟林妙妙坦白？林妙妙知道錢三一在國外的經歷之後會不會心疼他呢？
《少年派2》第21、22集中，錢三一終於鼓起勇氣吐露了自己在國外的那段經歷，他把在瑞士發生的一切原原本本告訴了林妙妙。
不過第一個知道錢三一祕密的不是林妙妙，而是雨嘉，錢三一在醫院跟雨嘉說了自己的事情，雨嘉鼓勵他跟林妙妙道歉。第22集中，在摩天輪錢三一跟林妙妙坦白了一切。
錢三一的導師是物理學界非常矚目的學者，是他的偶像，導師一直在研究非常深入的課題，錢三一的夢想是成爲像導師那樣頂尖的學者。但導師的死讓錢三一的夢想破滅了，導師是自殺的，因爲他突然明白了窮盡一生的研究方向是根本不存在的。導師臨死前留下了一句話，他說物理學是深不可測的，只是在不停地折磨着人類。
因爲導師的死，錢三一得了應激反應，他整個人陷入了焦慮、抑鬱之中，他不相信這就是科學家的一生，他開始產生自我懷疑，怕自己將來也會像導師一樣。
與此同時，林妙妙從江州坐飛機去國外看望錢三一，又恰好因爲冰島火山爆發被困在了機場，她跟錢三一徹底失去了聯繫。
錢三一的媽媽隱瞞了錢三一的病情，她只告訴林妙妙的媽媽錢三一正在國外專心搞研究，林妙妙就誤會錢三一不要自己了。這樣的誤會橫亙在兩人中間，好在後來錢三一把這一切都告訴了林妙妙，知道真相後的林妙妙原諒了錢三一。
