作為一種常用的清熱解毒藥，板藍根並不是每種感冒的萬能藥，它只適用於風熱感冒、流行性感冒等熱性疾病的治療，而風寒感冒、體虛感冒等並不宜使用。
板藍根對於由支原體、肺炎衣原體和軍團菌等引起的上呼吸道感染無效。即使同樣風熱感冒，不同患者也存在夾濕、內熱等個體差異，板藍根較適於體內藴熱的風熱感冒，對於風熱夾濕感冒的病人就不太適合。
對於它適用的風熱感冒，患者還要注意鑑別：風熱感冒的症狀是發熱較重，怕冷較輕，有汗不多，頭脹痛，肢體痠痛，咽紅腫痛，口乾欲飲，舌質紅，舌苔黃。流行性感冒症狀與此相似，但發病快、病情重，高熱，寒顫，肢體痠痛疲倦等。作為預防用藥時，還需要注意服用劑量和時間，不要大量和長期服用，服用時間以3天為宜。過敏體質及脾胃虛寒患者應謹慎用藥。
