木瓜內含大量的有機酸，如酒石酸、蘋果酸、檸檬酸等。此外，還有皂甙、維生素C和黃酮，經加工炮製後酸味和皂甙就可減少，易於吸收增效。若用浸酒泡服，有效成分更易為人體吸收利用，所以木瓜的酒劑較多。如祛風定痛、除濕散寒的有風濕木瓜酒，強筋壯骨、活血散寒的有豹骨木瓜酒等。
下面介紹木瓜的常用驗方：
腰痛：牛膝60克(温酒浸、切、焙)，木瓜1枚(去頂、瓤，入艾葉30克蒸熟)，巴戟(去心)、茴香(炒)、木香各30克，桂心15克(去皮)。
上為細末，入熟木瓜並艾葉同杵千下，下蜜為丸，如梧桐子大，每服20丸，空心鹽湯服。
幹腳氣，痛不可忍者：幹木瓜1個，明礬30克，煎水趁熱薰洗。
臍下絞痛：木瓜1~2片，桑葉7片，大棗3枚(碎之)，以水500毫升，煮取150毫升，頓服之。
赤白痢：木瓜、車前子、罌粟殼各等分。上為細末，每服6克，米湯水調下。
