女性月经周期以月经见红第一天为周期的开始，周期的长短因人而异，约为 21-35 天不等，平均约为 28 天，其中又以排卵日为分隔，分为排卵前的滤泡期与排卵后的黄体期。滤泡期长短不一定，但黄体期固定约为 14 天上下两天。
排卵后次日，因卵巢形成黄体，分泌黄体素会使体温上升摄氏 0．6 度 左右，而使体温呈现高低两相变化。高温期约持续 12-16 天 （ 平均 14 天 ）． 若无怀孕， 黄体萎缩停止分泌黄体素，体温下降，回到基本线，月经来潮。若是已经怀孕，因黄体受到胚胎分泌荷尔蒙支持，继续分泌黄体素，体温持续高温。若卵巢功能不良，没有排卵也没有黄体形成，所以体温将持续低温。
女性不孕症患者，常常先要进行基础体温测定，以初步判断是否有排卵，以及黄体功能是否健全。如果妇女基础体温持续升高超过16天，则有可能受孕，若持续20天不降，完全可以诊断早孕。
还有，原因不明的闭经妇女，通过基础体温的测定，能大致查出病变所在。如基础体温呈双相，说明体内性激素水平正常，病变很有可能为子宫内膜受损所致；若为单相型，即在后半期体温不升高，则表示病变部位可能在卵巢、垂体或丘脑。
检查目的
处于生育年龄正常排卵期的女性，由于受卵泡期、黄体期不同雌孕激素的影响，基础体温呈双相改变，根据排卵后基础体温升高速度、幅度及高温持续的时间，可以初步了解有否排卵及排卵后黄体功能情况。
如果黄体功能水平低，卵子就不容易着床，而且容易流产。 检查方法 每天清晨醒来，不说话不做事，将放于床头的体温计放入口腔中进行测量，并记录下测量的体温。这样，从这次月经到下次月经之间，每天早晨测量基础体温，记录一个月的基础体温曲线图。在特殊的日子，如感冒、发烧等问题，要做好特殊记号。一个月后，将所得的曲线交给医生，让她来考虑如何处理。
