各种先天性畸形，如先天性椎体融合、颅底凹陷等情况都易于诱导颈椎病的发生，这也是颈椎病的发病因素之一。
在对正常人颈椎进行健康检查或作对比研究性摄片时，常发现颈椎段可有各种异常所见，其中骨骼明显畸形约占5%。与颈椎病患者对比，后者颈椎的畸形数约为正常人的一倍以上。此说明骨骼的变异与颈椎病的发生有着一定关系。在临床上较为多见且与颈椎病发病相关性较大的畸形主要有以下五种：
以颈2～3和颈3～4最为多见，其次为颈4～5，多为双节融为一体，三节融合者罕见，间隔一节或二节形成双节双融合者亦少见。
由于椎体融合，两个椎体之间的椎间关节原有的活动量势必转移至相邻的上下椎节。按照颈椎的生物力学特点，当颈3～4以上椎节先天融合时，其下一椎节由于负荷增加而使该节的退变明显加剧，甚至出现损伤性关节炎，如同时伴有椎管发育性狭窄，则其发病时间更早。而椎管宽大者，或是靠近上颈椎者，其发病则较迟。
