外科手术能够纠正解剖生理异常导致的隐睾，或者假如宝宝对激素治疗没有效果，也需要做外科手术将睾丸拉入阴囊。比如，如果一条纤维组织索带阻挡了睾丸下降进入阴囊的通道，那么这些组织就必须通过外科手术袪除。
如果宝宝同时还伴有腹股沟疝（这是隐睾常见合并症，即一段肠管向外或向下突出腹腔外，甚至进入阴囊），则必须进行手术治疗。这种隐睾治疗手术通常需要住院进行。
如果牵引睾丸的韧带太短，可以通过手术加长。有时在外科手术中，医生发现韧带在通过外科手术加长前还需要生长一段时间，那么可能会在几个月后再给隐睾的宝宝做手术。
