如果患者肝功检查始终正常，则病情处于病毒携带状态，不需要进行抗病毒治疗。因为此时机体对于乙肝病毒的免疫功能处于耐受阶段，抗病毒治疗无法获得应答，治疗往往是“对牛弹琴”，收效甚微。
如果患者检查“乙肝病毒DNA”为阳性，肝功能检查提示谷丙转氨酶≥正常值2倍以上，则应进行抗病毒治疗。
治疗前建议做肝穿
乙肝病毒是体内潜伏的“特务”，它对人体的损害常常在体内静悄悄地进行。在进行抗病毒之前先做一次肝穿刺检查，可以明确肝组织炎症和纤维化程度，做到“有的放矢”，有针对性地决定使用那种抗病毒药物和抗病毒治疗方案。
首选药物
首次治疗可选干扰素、拉米夫定、阿德福韦和恩替卡韦，但是具体选用哪个又有讲究：
有明确乙肝家族背景(母婴传播)者，干扰素效果不佳;
肝功能失代偿阶段(如重型肝炎、重度黄疸、肝硬化腹水)的患者不能使用干扰素，它的免疫激活作用，可能使这些重病患者肝功能急剧恶化，威胁生命，此时只能选择拉米夫定;
拉米夫定最好不要用于儿童;
阿德福韦最好用于拉米夫定治疗发生病毒变异者。
