新生兒艾滋病檢測的影響因素
1、抗病毒藥物
一般艾滋病陽性母親的新生兒需使用ZDV進行預防以減少出生前傳播，艾滋病暴露的嬰兒也需要接受6周的抗逆轉錄病毒藥物的預防，雖然在理論上預防性抗逆轉錄病毒治療可影響新生兒病毒學艾滋病檢測的預測值，但是實際上ZDV的單獨預防並不能夠延緩艾滋病培養呈現陽性的時間，也沒有減少病毒學實驗的敏感性和預測值。尚不知道母親及新生兒本人的聯合抗病毒治療是否影響艾滋病檢測結果。
2、艾滋病基因變異
HIV DAN PCR檢測方法一般都是針對HIV-1 B亞型毒株設計的，艾滋病檢測非B亞型的毒株敏感性可能不好，已經有非B亞型病毒感染的嬰兒HIV DNA PCR檢測假陰性的報道。
因此對於感染非B亞型毒株的母親所生的嬰兒，解釋HIV DNA PCR的陰性結果需要特別小心。現在使用的HIV RNA定量檢測方法增加了艾滋病檢測非B亞型病毒的敏感性，但是仍不可以檢出全部非B亞型病毒，特別是0羣病毒。
因此對於暴露於非B亞型病毒的嬰兒應該特別注意，HIV DNA PCR檢測爲陰性時，最好用新的HIV RNA方法進行重複艾滋病檢測，對於HIV DNA PCR和HIV RNA檢測均爲陰性仍然懷疑非B亞型病毒感染的孩子，可以諮詢兒科艾滋病感染方面的專家，密切監測，得出確定的診斷需要等待孩子長大到18個月時。
