良性软骨母细胞瘤多为良性肿瘤，肿瘤局限在起源的骨骺处，极少穿透骨骺软骨到达干骺端。一般在骨端中央或偏心部位，呈卵圆或圆形的破坏病灶。常有一界阴清晰的硬化边缘。良性软骨母细胞瘤的治疗以手术联合生物免疫治疗为主。
良性软骨母细胞瘤的治疗是以彻底刮除肿瘤组织后行植骨术为主。
术后局部复发率约为25%。不作植骨的复发率高达60%。应用冷冻技术结合刮除手术可降低复发率。
若肿瘤小，偏心生长，可作包括周围正常骨的肿瘤局部切除术。肿瘤大而生长速度快者，宜作大块切除术。
复发性肿瘤或有恶变者应考虑作节段切除或截肢术联合生物免疫治疗。
肿瘤生物免疫疗法可以直接追踪识别、特异性清除术后残余的肿瘤细胞，克服了手术、放化疗三大传统治疗方式“不彻底、易转移、副作用大”等弊端恢复、营造正常人生存所需要的正常机体环境，最终实现防止肿瘤的转移和复发，并且循序提高免疫力，延长患者的生命周期，提高患者的生命质量，或可治愈肿瘤。
肿瘤生物免疫治疗与现代手术、化疗和放疗方法联合应用具有很强的互补作用，不但具有清除体内不同部位的微小残留病灶、防止肿瘤复发与转移的作用，而且对病人受损的免疫系统又能起到恢复与重建的独特疗效。
