像任何治疗手段一样，米非司酮也具有局限性，只能抗早孕;出血多，出血时间长是其致命弱点。影响米非司酮安全使用的因素很多，必须有医生的帮助才行。有关部门明确规定，在第三天服最后一次药后，要“留医院观察”，而具备留医院观察条件是只有达到一定规模的大医院。
遗憾的是，不仅在一些不具备条件的中小医院里做起了米非司酮流产手术，而且在部分个体药房里居然也有该药出售，主要是昂贵的利润诱惑商家或诊所。在一些药店，一片米非司酮片的要价竟然是正规医院一套抗早孕药(6粒米非司酮片，3粒配伍的前列素片)价格的2倍。
另外，有的不法厂商鱼目混珠，生产销售假避孕
其手法主要有3种：一种是用淀粉、葡萄糖粉等原料冒充;第二种造假手段是使用过期原料，这种假避孕药同样存在药效降低或完全失效的危险;第三种造假的情况是假避孕药中所含有效成分的剂量不够。这三种手法都会危害妇女的身心健康。米非司酮的有效成分缺乏或剂量不足，会造成避孕失败而意外怀孕，只有接受手术或药物流产，蒙受痛苦和风险。而假抗早孕药会使妊娠妇女药物流产失败，不得不通过刮宫等手术做人工流产。
