中國醫藥企業管理協會會長於明德介紹，所謂產業結構調整，巨集觀上是經濟轉型的要求，是追求數字背後的社會效益、環境效益等綜合效益。他透露，即將出臺的生物醫藥“十二五”規劃中就沒有過於強調產業增速等數字化目標，而更重視“轉型”和“升級”，這也與產業的結構調整是一脈相承的。
《意見》明確了醫藥產品結構調整方向，對基本藥物將鼓勵做大規模和提高市場佔有率，對化學藥則推崇仿製研發和工藝創新。此外，基因工程藥物、抗體藥物、現代中藥、醫療器械都被列為重點發展方向。
分析人士表示，《意見》對醫藥行業整體比較正面，傳承以往多次提到的“提倡創新、提高集中度”等內容，但此次形成了一個檔案，說明政府的重視程度較高，因此，創新型醫藥企業得到了肯定。
業內專家預計，我國普藥行業將掀起整合浪潮，其中龍頭企業包括雙鶴藥業（600062）、東北製藥（000597）、華北製藥（600812）、西南藥業（600666）等將重點受益。此外，雙鷺藥業（002038）、恆瑞醫藥（600276）等創新型藥企有望享受政策支援。同時，分析人士指出，現代中藥領域比較出色的天士力（600535）、康美藥業（600518）、康緣藥業（600557）、康恩貝（600572）等公司也值得投資者關注。
此外，《意見》明確指出“將抓住世界仿製藥市場快速增長的機遇，擴大製劑出口”，這意味著政策將對藥物製劑產業加大支援力度，相關的上市公司包括海正藥業（600267）、美羅藥業（600297）等有望獲得支援。
