在品級上來看，尚書要比總督大，不過兩者擁有的權利是不一樣的。尚書爲從一品，而總督是屬於正二品，但是在清廷的實際情況中，總督的權利要比尚書更大一些，時代不同權利自然有所不同。
尚書是從一品的京官，在皇帝身邊做事，地位自然也是很高的。不過尚書雖然地位很高，但手中並沒有相對應的權利。總督大人雖然是正二品銜，但是總督的手中握有軍事和行政大權，也是真正的封疆大師，地方諸侯。
在清代時期，爲了加強對各地的統治，清朝的總督都會升職，一般都是給加兵部尚書銜或者東宮三師銜，從而成爲從一品，而且手中的權勢依然還在。
在清朝的總督中，直隸、兩江、湖廣、兩廣、閩浙這五個地方的總督，權勢和地位比較大，一般都會以兵部尚書、右都御史銜兼任。在這種情況下，任職兵部尚書副職的兵部侍郎銜總督，品秩和實權就要低於兵部尚書了。
