月餅本身是高熱量、添加多油脂的食品，由於用了各種餡料，因此糖分高、脂肪含量也高，部分還是高膽固醇，吃多了肯定不好，因此要控制好食用量。
老人和小孩吃月餅時，食用量不能太多，特別要注意切小塊吃，以免噎着。除了晚上睡前，其他時間都可少量吃點，但一次不要超過1個。早晨人體的消化功能是比較弱的，月餅是高糖高脂食品，不利於消化，健康的年輕人偶爾一兩次把月餅當早餐是沒關係的，次數太頻繁就不對了。
大部分糖尿病、腸胃功能較弱、三高心血管疾病等人羣都明白月餅不能多吃，但平時沒有症狀的膽道疾病患者，中秋節日期間也更該保持飲食清淡，不要攝入過多油脂，否則慢性會轉爲急性。此外，對於心血管疾病患者來說，如果食用月餅過量，副作用可能不會馬上體現出來，但存在潛在風險。
由於月餅本身已經是高油脂、高熱量的食物，因此最好不要攝入熱卡太高的飲料，如碳酸飲料、果汁等。吃月餅時應該選擇有助消化的東西，如開水、清茶、花茶等。此外，品嚐月餅時也不要吃冷飲，如啤酒、雪糕之類，容易造成噁心甚至腹瀉等症狀。
很多人也是直接將月餅放到冰箱裏保鮮，想吃的時候再拿出來。王亦萍建議，月餅不宜放入冰箱儲存，因爲在低溫的條件下，澱粉會變得老化，使月餅變硬、口感變差。儲存月餅最好放置在室內陰涼乾燥處，要注意儲存時間不要太長，散裝月餅可以放置三五天;有獨立小包裝，或包裝中有防腐料包的月餅，可以保存十幾天，最遲不要超過一個月。
