性交困難的原因有男方與女方兩個方面。
男方常見的原因
1.性功能障礙。如患陽痿，陰莖不能勃起或陰莖勃起不堅，陰莖不能插入陰道;又如早泄，由於射精過快，可於陰道外射精，射精後陰莖即疲軟，招致陰莖不能插入陰道。
2.生殖器畸形。如兩性畸形，陰莖過於短小，陰莖無法與婦方交接。
3.不懂性知識。男方對女性生殖器構造及性交基本知識一無所知，性交時動作笨拙，方向不明，不知所措，停留在外陰部盲目撞擊，性器未曾交合。
治療：
1、心理治療。對女方屬敏感的神經類型者，或小時受過不正當性教育，或過去有受過性強暴病史者，特別要注意心理疏導，使之解除顧慮，消除緊張，焦慮及恐懼的情緒，在性愛中精神方鬆安然交接，真正享受到性愛的愉悅。
2、尋求諮詢。夫婦生活中，一旦發生性交困難，要及時到性學諮詢門診諮詢，請求醫生幫助分析性交困難的原因，從而針對處理。
3、手術治療。對一些確因器質病變造成性交障礙者，如陰道瘢痕狹窄，外陰巨大橡皮腫，處女膜閉鎖，先天性無陰道等，可進行手術治療。
預防：
1、性交時男方避免粗暴。
2、加強體育鍛煉，注意性衛生，保持情緒愉快。
3、及早治療原發病。
