由於乙肝疫苗屬血源性的，在製備過程中純化與滅活程序十分嚴密，故不會產生像破傷風等動物血清疫苗可能造成的過敏反應，也不會感染上乙肝、艾滋病及其他傳染性疾病。與其他疫苗同時接種亦末出現相互干擾作用;因此，可以說，乙肝疫苗是安全可靠的預防疫苗，注射前也不必皮試。
至於注射時應當注意的事項大致有以下幾個方面：
1.新生兒第一針必須在出生後24小時內注射，若超過48小時後注射。則預防效果降低。出生後一個月仍未行注射者，則應先檢測有關乙肝指標，證實未被感染者，可與乙肝高效價免疫球蛋白，(HBIG)合用。
2.凡發熱、嚴重感染及其他嚴重的全身性疾病者，應暫緩接種。
3.乙肝疫苗與其他疫苗如白百破;卡介苗、乙腦疫苗等同時接種，互相之間無干擾作用;但有人認爲若與麻疹疫苗同時接種，有可能降低麻疹疫苗的免疫效果，故二者最好分開接種。
4.注射第3針疫苗後的1-3個月，應到醫院檢測保護性抗體(抗-HBs)水平，以判斷免疫效果。若無效者，需行加強注射一次。
5.注射後局部應保持衛生，最好三天內不要擦洗，以免抓破引起局部感染。
6.凡對福馬林或硫柳汞及其他藥物過敏者禁用。
7.成人注射前需先檢測乙肝病毒(HBV)指標，已有感染，或感染後已痊癒併產生保護性抗體者，不需注射疫苗。
