腎盂腎炎又稱上尿路感染，是一種常見的泌尿系感染性疾病，臨牀上常因發現或治療不及時而出現並發生症，常見的併發症如下。
腎膿腫及腎周圍膿腫
血源性腎盂腎炎是全身性菌血症或敗血症的局部表現，血源性病原體播散到腎間質，形成微小膿腫，如不及時治療，微小膿腫融合發展成較大膿腫，膿腫穿破腎實質則可形成腎周圍膿腫，膿腫擴大破壞了全腎則成爲膿腎。病人除有全身敗血症症狀，如寒戰、高熱及全身不適外，腎區脹痛，觸診時疼痛加劇，如伴有尿路梗阻則病變進展更快。
敗血症
急性腎盂腎炎合併有尿路梗阻，尿流不暢時腎內病原體往往可播散入血循環，形成膿毒敗血症，稱之爲尿路敗血症，確切地說應稱爲腎源性敗血症。多由革蘭陰性桿菌所致，病情嚴重，約半數以上發生休克，進而導致急性腎衰竭。
急性腎衰竭
併發急性腎衰竭的單純性急性腎盂腎炎是由血源性感染所致，病原體多爲金黃色葡萄球菌，是全身菌血症或敗血症的局部表現，實際上它是急性敗血症的併發症，敗血性休克或急性血容量不足和內毒素的作用就可發生急性腎衰竭。
急性腎乳頭壞死
急性腎乳頭壞死爲腎盂腎炎的嚴重併發症，常在糖尿病或慢性間質性腎炎基礎上的腎感染時多見，目前認爲腎髓質原有缺血是本病的基礎，再發生細菌感染則產生急性腎乳頭壞死（即急性腎髓質壞死），其臨牀特點爲急性腎衰竭，同時有肉眼血尿，血塊及壞死乳頭組織隨尿排出時可引起不完全性梗阻症狀。若爲兩側病變可引起急性腎衰竭。
