急性腎炎如果治療不徹底，很可能轉爲慢性腎炎，很多人就此認爲慢性腎炎的病因是急性腎炎。這並不完全正確。急性腎炎和慢性腎炎的病因的關係是存在的，但是慢性腎炎也可能是自行病變發作的。
慢性腎炎是一組多病因的慢性腎小球病變爲主的腎小球疾病，但多數患者慢性腎炎的病因不明，與鏈球菌感染並無明確關係，據統計僅15%～20%從急性腎小球腎炎轉變而至，但由於急性腎小球腎炎亞臨牀型不易被診斷，故實際上百分比可能要高些。
此外，大部分慢性腎炎患者無急性腎炎病史，故目前較多學者認爲慢性腎小球腎炎與急性腎炎之間無肯定的關聯，慢性腎炎的病因可能是由於各種細菌、病毒或原蟲等感染通過免疫機制、炎症介質因子及非免疫機制等。
慢性腎炎在初期症狀不是很明顯，這也是慢性腎炎的病因不容易確認的原因之一。作爲常見的腎科疾病，慢性腎炎對腎功能的危害是隨病情深入而不斷加深的，當症狀比較明顯時，慢性腎炎的病因往往已經無從尋找。
