傳統治療法
傳染性軟疣雖然可以自愈，但症狀可能會持續數月至數年，因而適時的治療以消除症狀是患者的迫切要求，而軟疣的傳染及自我接種，主要原因是軟疣小體內存在的大量， 因而治療的關鍵即是消除軟疣小體。
傳統的治療方法雖然能達到治療目的，但每次均只能針對已成熟的損害,對一些小的或未成熟的疣體往往不能挑出或刮除，因而必須分次治療，費時費力。
微波治療法
微波是一種電磁波，微波治療是利用電磁能的輻射，當微波進入人體時，可使組織內電解質偶級離子隨微波頻率變化而發生取向運動，在高速振動與轉動過程中互相摩擦產生熱效應，可使軟疣小體凝固壞死而被消除，達到治療目的。而且可以針對成熟及未成熟的軟疣，一次性全部清除，明顯縮短了治療的週期。
國內資料顯示微波對於多種皮膚病都行之有效。它與冷凍相比，不會形成張力性水皰，避免了繼發性感染，患者的痛苦也小，易於接受，與電離子及2激光相比，不產生煙霧、無臭味、不出血，治療層次清晰，提高操作時的能見度,深度範圍易於控制，有效提高了治療的精確性。在治療過程中，焦渣易黏附於探頭，需用生理鹽水棉籤或石蠟油棉籤擦拭將其清除乾淨，以有利於觀察皮損清除情況和觀察治療深度，另外在清除完疣體後，將探頭與創面垂直方向。輕點創面，使之形成一凝固面，這樣可避免創面感染並有利於創面的癒合。
