十二指腸良性腫瘤的臨牀症狀無明顯特徵性，一般症狀可出現上腹部不適，食慾減退、噯氣，反酸等類似慢性胃炎、胃潰瘍病的症狀。因此，十二指腸良性腫瘤易與這些消化道疾病相混淆。十二指腸良性腫瘤典型症狀爲腹痛和消化道出血。
1.腹痛
約30%的十二指腸腺瘤******肉的病人可出現間歇性上腹部疼痛，伴噁心、嘔吐。帶蒂的十二指腸息肉位於降部以下時可引起十二指腸空腸套疊，而球部巨大腺瘤可逆行進入幽門，導致急性幽門梗阻，稱爲球狀活瓣綜合徵。位於十二指腸的平滑肌瘤由於腫瘤的牽拉，腸管蠕動失調以及瘤體中心壞死而繼發的炎症反應、潰瘍、穿孔等都可以引起腹痛。巨大良性十二指腸腫物如引起腸管梗阻也可造成相應的腹痛、噁心、嘔吐症狀。
2.消化道出血
25%～50%的十二指腸腺瘤和平滑肌瘤的病人可出現上消化道出血癥狀。這主要是由於腫瘤表面缺血、壞死，潰瘍形成所致。臨牀上主要表現爲急性出血和慢性出血。急性出血以嘔血、黑便爲主；慢性出血則多爲持續少量出血，大便潛血試驗陽性，可導致缺鐵性貧血。也有報道十二指腸巨大錯構瘤和血管瘤引起消化道大出血。
3.腹部腫塊
巨大的十二指腸良性腫物可以腹部腫塊爲主要症狀，特別是腸腔外生長的平滑肌瘤，可在腹部體檢時捫及腫塊，一般較爲固定，界限較清楚，其質地因病理性質而異，可柔軟而光滑，或堅韌而不平。
4.黃疸
生長在十二指腸降部乳頭附近的良性腫物，如壓迫膽道下端及乳頭開口部位，可出現不同程度的黃疸。
5.其他
位於十二指腸部位的神經內分泌腫瘤可根據其腫瘤細胞構成情況引起相應的臨牀表現，如胃泌素瘤導致的卓-艾綜合徵；家族性腺瘤肉病患者特有的脣及頰黏膜色素沉着等。
