主要症狀是反覆發作急性扁桃體炎。也有部分患者無明顯急性發作史。表現爲經常咽部不適，異物感，發乾，癢，刺激性咳嗽，口臭等症狀。兒童過度肥大的扁桃體可引起呼吸、吞嚥、語言障礙。若伴有腺樣體肥大可引起鼻塞、鼾聲及卡他性中耳炎症狀。由於經常嚥下分泌物及隱窩中的細菌毒素，可致消化不良，頭痛，乏力、低熱等症狀。
臨牀上爲記錄方便，可將扁桃體的外形大小分爲Ⅲ度：扁桃體超出舌齶弓，但未遮蓋咽齶弓者爲Ⅰ度;已遮蓋咽齶弓者爲Ⅱ度;超出咽齶弓突向中線者爲Ⅲ度。但扁桃體的大小不能作爲炎症的指徵，因爲兒童有生理性肥大，成人多萎縮。
