1、淋病病因病机复杂，传统治疗单一：临床表明淋病的发病不是单一病种发病。它的发病复杂多变，在治疗过程中淋球菌容易隐藏在生殖器官中，如果不能有效的同时治疗，治疗效果大打折扣。
2、不规范合理治疗，病菌产生耐药性：研究约90% 以上的淋球菌对青霉素耐药，使得传统的药物治疗效果差，对器官的危害增加，病情难以治疗、缠绵发作。
3、新生菌株毒性、危害性、杀灭难度增加：在临床检验分析中发现淋球菌出现很多新的菌株，这些菌株对正常组织结构危害性增加，并且对抗生素的杀灭和免疫系统的吞噬作用有灵活的躲避作用，传统治疗很难有效杀灭。
4、缺乏专业诊疗，盲目治疗延误病机：临床中缺少专科诊疗和专科的医生，以及有效的治疗方法和技术。病人盲目打针、吃药，不但给治疗带来困难，延误疾病治疗，严重危害身体健康。
根据性传播疾病大量临床治疗经验总结，专家得出结论：性传播疾病的最佳治疗时间是染病后的1-2天以内，而且是越早治越好，因为此时治疗可很容易清除细菌和病毒，防止病情的发展和扩大，一旦拖延不治，则增加临床治疗的难度。
特别要指出的是，一旦发生了不洁性行为，即使采用了安全措施，仍要注意自己的身体变化。如果出现了淋病的典型症状，如尿频尿急尿痛、尿道口流脓等，一定要及时去医院治疗。除艾滋病外，各大性病都是早期容易治疗，拖得越久，治疗就越麻烦。
