使用高锰酸钾水溶液坐浴治疗阴道炎也应按不同情况分别对待。
对于由葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌和变形杆菌等细菌感染引起的阴道炎和滴虫性阴道炎，都可以用高锰酸钾水溶液坐浴作为辅助治疗。因为这些病原微生物不适宜在酸性环境中生长，容易被高锰酸钾杀灭。而霉菌性阴道炎主要是由念珠菌引起，这种霉菌平时可在阴道中寄生。
在机体抵抗力降低或长期大量应用广谱抗生素等药物时，念珠菌会因菌群紊乱而迅速繁殖，从而导致阴道炎的发生。如此类阴道炎用高锰酸钾治疗，非但不能抑制霉菌繁殖，有时甚至会加重病情。对霉菌性阴道炎，可用碱性溶液加2～4%碳酸氢钠冲洗外阴及阴道作为辅助治疗，以造成不利于念珠菌生存的碱性环境。
由此可见，妇女使用高锰酸钾应当慎重，最好在医师指导下使用，不要一发现外阴或阴道发炎，就马上用高锰酸钾水溶液坐浴，而是应当确诊属于哪种类型的阴道炎。
此外，也不要长期使用高锰酸钾，以免阴道里的菌群紊乱。使用高锰酸钾还应注意，由于高锰酸钾放出氧的速度慢，浸泡时间一定要达到5分钟才能杀死细菌。配制水溶液要用凉开水，热水会使其分解失效。
配制好的水溶液通常只能保存两小时左右，当溶液变成褐紫色时则失去消毒作用。故最好能随用随配。
