男性不育的主要原因是精子數量少、精子畸形率高或活動度差以及射精功能障礙或精液輸出管道阻塞。
很多先天性疾病和外傷等後天性包括慢性健康問題、不良生活方式和其他的多種因素包括生活環境、食物、藥物、生活習慣均是導致男性不育的重要原因。通過對男性患者、其配偶或者雙方同時治療，相當一部分男性不育症是可以得到治療。
疾病因素
1、 影響精子生成和精液質量的因素；
a） 精索靜脈曲張
b） 感染
c） 精子抗體
d） 腫瘤
e） 隱睪
f） 內分泌紊亂
g） 染色體異常
h） 腹腔或盆腔疾病
i） 某些藥物#p#副標題#e#
2、 影響精液射出的因素
a） 輸精管道病變
b） 腹腔或盆腔疾病
c） 某些藥物
d） 性慾減退
e） 勃起功能障礙
f） 射精功能障礙
環境因素
1、 殺蟲劑
2、 暴露於重金屬環境
3、 X射線或放射線
4、 睪丸溫度過高
5、 長時間騎自行車
生活方式
1、 吸毒
2、 酗酒
3、 吸菸
4、 精神緊張
5、 維生素缺乏
6、 肥胖
7、 老齡
