人體的免疫系統，免疫系統是一個極爲複雜的系統，在維持機體的穩態和健康方面起着重要的作用。免疫系統主要有三大功能，即抵禦外來的致病微生物侵襲，清除自身衰老死亡的細胞以及識別並清除突變的細胞，因而是維持機體內環境穩定的必不可少的生理性防禦機制。
當免疫系統防禦功能發生異常，則會導致一系列免疫病理過程，如感染、免疫缺陷、自身免疫性疾病以及腫瘤等的發生，也可能導致生殖過程的障礙。
一般自身組織不成爲抗原，但在有些情況下也會產生抗體，如感染，經血倒流，燒灼或藥物作用等，能使組織細胞中的蛋白質發生質的變性而成爲自身抗原，這種物質一旦進入血循環，刺激機體則可產生免疫反應。
抗子宮內膜抗體就屬於自身抗體，在正常育齡期女性中也可以檢測到，但在不孕症人羣中，特別是患有子宮內膜異位症的女性中更多見。
正常機體具有自身免疫調節功能，產生極弱的自身抗體，幫助清除體內衰老變性的自身成分，一旦由於某種原因導致免疫系統對自身組織產生過度免疫應答，則會發生過強的一系列免疫反應，致使所侵及的組織免疫活性細胞增多，免疫複合物沉積，而導致功能改變。
當這種抗子宮內膜抗體由於反覆刺激而大量產生達到一定的含量時，可與自身的子宮內膜組織發生抗原抗體結合反應，並激活免疫系統引起損傷性效應，造成子宮內膜組織細胞生化代謝及生理功能的損害，干擾和妨礙精卵結合，受精卵的着牀和胚囊的發育而導致不孕或流產。但是，這種免疫不孕是相對概念，是指免疫使生育力降低，暫時導致不孕。
不孕狀態能否持續取決於免疫力與生育力間的相互作用，若免疫力強於生育力，則不孕發生，如後者強於前者則妊娠發生。不孕常有多種因素同時存在，免疫因素也可作爲不孕的唯一原因或與其他病因並存。
