在一般情況下，男性精液因爲血睾屏障而不會受到免疫系統的破壞，但在一些特殊情況下，男性自身的免疫系統會破壞這道屏障，危害精子造成男性不育，這就是男性的免疫性不育。造成男性免疫性不育的原因主要有以下三方面。
1.精子自身免疫
精子的自身免疫是指男性機體對自身精子產生了抗原性的免疫應答，也就是機體對自身的精子形成抗體或某種殺滅作用的淋巴細胞，而精子本身雖然有多重抗原，但效用低或發生改變，加之自身的耐受性受到破壞，在不應當發生免疫應答的情況下產生了免疫應答，致使精子細胞受到損傷，從而導致男性不育。
2.特異性抗原
在正常情況下，精液中含有的抗原及抗體不會對精子造成傷害，但某些特殊情況下，部分抗原改變爲精子的特異性抗原，並刺激男性機體形成特異性抗體，對精子的發育和成熟產生諸多不利影響，刺激及傷害精子，導致男性不育。
3.血睾屏障被破壞
由於某些化學、物理或生物因素對血睾屏障的破壞，導致該屏障無法發揮保護精子的作用，部分血液進入睾丸，血液中的吞噬細胞吞噬精子，並識別處理精子抗原，將信息傳遞給淋巴細胞，導致機體分泌體液或對睾丸組織產生免疫應答，使得睾丸、輸精管等組織被破壞，發生免疫性睾丸炎，導致男性不育。
