有些患者貪圖方便或是害怕隱私被泄露，而選擇了沒有專業執照的醫生診治。由於知識的缺陷和專業設備的缺乏，這些醫生往往還未查清患者得的是哪一種生殖感染疾病就亂用藥物治療，而完全不顧由此可能帶來的嚴重後果。這種“無的放矢”的治療，不僅不能緩解病情，還可能引起嚴重的併發症和後遺症。以梅毒的治療爲例，早期病症經專業醫院治療是完全可以治癒的，但是如果隨便使用抗生素，就很可能會使疾病轉爲潛伏和隱匿性病症，並伴有傳染及復發的可能。由此可見，不正規的治療可能導致病情的隱蔽發展，容易使病程遷延至晚期而失去徹底治癒的機會。
此外，還有些患者容易迷信偏方，最終卻得不償失。偏方有時可能在某段時間內使病情有所好轉，於是患者就以爲自己的疾病已經痊癒了，這種認知很容易在無意中造成生殖感染疾病的擴散。由於缺乏專業醫生的指導，很多自行治療的生殖感染患者沒有將自己使用的腳盆、毛巾、便具等用品進行消毒和隔離，而禍及家庭成員。
這些情況的發生都說明不規範的治療不僅危害個人健康，而且可能引起生殖感染在家庭及社會上的進一步擴散，其後果十分嚴重。有鑑於此，建議患有生殖感染的患者不可私自盲目治療，應儘快到正規醫院接受系統檢查，確診後積極治療並定期複查，生殖感染疾病並不可怕，只要遵循醫囑，樹立信心，絕大多數的生殖感染疾病是可以治癒的。
