肛瘻是由肛門局部感染所引起，同時肛瘻形成後經常有膿水外溢，肛門部潮溼難受，所以注意肛門部清潔衛生極爲重要，應經常用溫水泡洗肛門，最少每晚要洗一次。一則可保持局部清潔。二則可改善肛門部血液循環，增強抵抗力，減輕炎症反應。一般可用溫鹽水(3000毫升溫水中加30克食鹽)外洗，亦可選用明礬水外洗(3000毫升溫水中加明礬60克)。
肛瘻發炎化膿時，如外口閉塞，可用消毒的針頭挑破外口，排出膿液，既可減輕脹痛，又可預防膿液向其他部位蔓延。同時可用清熱解毒的中藥(黃柏15克、蒲公英10克、朴硝30克、大黃30克、地丁草15克)煎湯外洗。
中醫認爲肛瘻是溼熱引起，所以油膩生溼的食物應有所節制，戒除菸酒、嗜茶的習慣，應多食清淡並含有較多維生素的食物，如冬瓜、絲瓜、綠豆、蘿蔔等。經久不愈的肛瘻多屬虛寒型。飲食上宜選有健脾和胃、益氣補血、含有豐富蛋白質、維生素的食品，如瘦肉、牛肉、蘑菇、大棗、芝麻等。
如肛瘻的分泌物多時，內褲要勤換、勤洗暴曬，也可用肛門帶保護肛門，以免過多污染內褲。肛門帶亦要經常換洗，不要讓膿液、分泌物積留患部。
