肛瘻大部分肛瘻由肛門直腸膿腫破潰或切開排膿後形成，在癒合縮小的過程中，形成慢性感染性管道。
1.爲預防和減少新生兒和小嬰兒發生感染性肛瘻，必須注意肛門衛生。家長習慣在換尿布時順手用尿布擦一下肛門和外陰，並且誤認爲尿布很乾淨，也很柔軟，其實對新生兒和小嬰兒來講，尿布還是有些粗糙和不衛生的。
2.最好在便後用裝有溫水或硼酸水的小壺沖洗肛門和外陰，然後再用乾淨的棉花或軟布輕輕擦乾，這樣就能減少肛門周圍皮膚及外翻的直腸粘膜的損傷，達到預防感染的目的。
