腎盂腎炎可分爲急性和慢性兩種，不同時期其症狀也會有所變化。
急性腎盂腎炎
全身症狀：患者大多起病急驟，常有39℃以上的高熱、寒戰或畏寒，全身不適、食慾減退、乏力、頭痛，有時噁心或嘔吐等。輕症患者可無全身表現。
尿路系統症狀：尿急、尿頻、尿痛等膀胱刺激症狀是患者最突出的表現，每次排尿量很少，時有尿淋漓，大部分患者有腰痛或向會陰部下傳的腹痛。
慢性腎盂腎炎
近年來提出腎盂腎盞有瘢痕形成，靜脈腎盂造影可見腎盂腎盞變形、積水、腎外形不光滑，或二腎大小不等，被稱爲慢性腎盂腎炎。
患者症狀比急性期輕，半數以上有急性腎盂腎炎的既往史，隨後有低熱、乏力、厭食和腰痠腰痛等症狀，並伴有尿急、尿頻、尿痛等膀胱刺激症狀。
患者腎小管功能可有損害，如出現低滲、低比重尿，夜尿增多，濃縮功能減退和腎小管性酸中毒等症狀。
腎性高血壓很多由慢性腎盂腎炎引起，少數患者切除一側病腎後，高血壓會有所改善。
晚期患者可發生腎小球功能損害，氮質血癥直至尿毒症。
