肛管直腸周圍膿腫有兩大類：一類與肛腺及肛瘻有關，稱爲“原發性急性肛腺肌間瘻管性膿腫”簡稱“瘻管性膿腫”，較多見;一類與肛腺及肛瘻無關，稱爲“急性非肛腺性非瘻管性膿腫”，簡稱“非瘻管性膿腫”較少見。
現代醫學認爲，肛瘻的病因主要是細菌感染，細菌侵犯的部位是肛隱窩、肛門腺導管和肛門腺體，肛門腺感染、化膿，形成肛周膿腫，自然破潰，或經手術切開排膿後形成肛瘻。
肛瘻不能自愈，手術後容易復發，究其原因可能有以下一些。
（1）內口的存在：膿腫雖然破潰或已切開引流，但原發感染源如肛竇炎、或肛腺感染依然存在，腸腔內容物還可從內口繼續進入瘻管;
（2）肛門部不能靜養，膿腔不易粘合：排糞、排尿時，因括約肌收縮或因炎症刺激肛門括約肌，使肛門括約肌經常處於痙攣狀態;
（3）腸腔中的糞便、腸液和氣體繼續進入瘻管，刺激管壁，使管壁結締組織增生變厚，管腔難以閉合;
（4）膿腔引流不暢，或外口縮小，時閉時潰，膿液蓄積腔內，導致膿腫再發並穿破而形成新的支管或瘻道;
（5）管道多在不同高度穿過肛門括約肌，括約肌收縮阻礙膿液排出，以致引流不暢。除此之外，結核、克隆氏病、潰瘍性結腸炎等都是形成肛瘻的原因。所以，患者一旦發生肛瘻，應儘早去正規醫院就診，根據不同的肛瘻類型，選擇相應的治療方法。
