某些藥物合用會增加毒性反應，如阿司匹林和消炎痛合用，雖然都是退熱止痛和抗風溼的藥物，但合用不僅不能增強療效，反而易加重胃腸道毒副作用，使胃出血機會明顯增加。氨基糖甙類抗生素如鏈黴素、慶大黴素、卡那黴素之間聯合使用時，耳毒性和腎毒性會明顯增加，如和其它耳毒性藥物如紅黴索、速尿、利尿酸合用時，更易引起永久性耳聾。
在充血性心力衰竭時，同時使用地高辛和安體舒通以強心利尿，安體舒通會導致地高辛瀦留，血藥濃度增加，出現毒性反應，所以如需聯合使用，主張降低地高辛劑量，並進行血藥濃度監測。
現在口服維生素以期增加免疫力的人較多，但維生素除不能過量服用外，一些維生素和其它藥物合用時也易引起不良反應，如維生素C如和磺胺類藥物合用，後者容易在酸性尿液中析出結晶，沉積在腎臟，可嚴重損害腎臟。
和紅黴素同時服用時，紅黴素在酸性環境中效果明顯降低。西沙比利是一種常用的胃腸促動力藥，對消除腹脹、噁心、早飽、便祕等都有較好療效，但是在美國，上個世紀90年代期間，一些病人使用西沙比利後出現嚴重心律失常等心臟反應，其中有病人而死亡。
在醫藥界也曾經引起廣泛震驚和關注，後經權威人士分析調查，絕大部分病人是同時使用了和西沙比利配伍禁忌藥物或本身伴隨禁忌證，也就是說，絕大多數嚴重不良反應是因爲不合理用藥導致，如果能夠合理處方，完全可以避免這些不良反應的發生。
除了西藥之間有配伍禁忌外，中藥包括中藥注射劑，口服劑之間也有配伍禁忌，中西藥之間也有配伍禁忌。如果不合理的多藥並用，一樣引起療效下降和毒性增加。如四環素類、大環內酯類抗生素不宜和牛黃解毒丸、止咳定喘丸、龍牡壯骨沖劑等同時服用，以免生成難溶性化合物或絡合物而影響吸收、降低療效。
強心苷類藥物不宜和含有麻黃鹼的複方川貝精片、複方枇杷糖漿等合用，以免使洋地黃、地高辛等作用增強，毒性增加。銀杏葉製劑和阿司匹林同服有誘發顱內出血的危險、解熱止痛藥和硃砂、巴豆合用可致消化道出血及穿孔。諸如此類的配伍禁忌是非常多的。
要減少藥物的不良反應，就要嚴格掌握適應症，用藥時品種宜少，最好不超過3-4種，如病人同時患多種疾病，在治療中以處理主病爲主，同時兼顧其它。除了醫師、藥師要了解 藥品的作用儀、適應症及各種不良反應，儘量不開不必要的處方外，公衆要樹立起自我保護意識，不要隨便服用藥物，更不能隨意多藥並用。
事實上有—些病人，特別是老年病人拿一張清單，列有七、八種或十餘種藥，要醫師按單開藥，說自己有多種病，要吃這麼多藥，這是不太好的。老年人服藥更需注意要克服“吃藥總比不吃好”“吃多些藥比吃少些藥好”的觀念。儘量在醫師、藥師指導下用藥。如自購藥也要到正規藥店，認真閱讀藥品說明書，必要時諮詢醫師，這樣纔有可能減少藥物不良反應的發生，有效的維護健康和保障生命安全。
