蛤蚧具有補肺、滋腎、益精助陽、止渴通淋、定喘止咳的功能。李時珍譽其“補肺止渴、功同人參”，“補肺潤骨，益精助陽，治渴通淋，定喘止咳，肺痿咳血，氣虛血竭者宜之”。
根據臨牀觀察，蛤蚧表皮下富含激素，的確能強壯心身，對神經衰弱、小便頻繁、哮喘、小兒疳積等，確有良效。南方民間常將鮮蛤蚧與豬肉或其他肉類一道煮吃，或以幹蛤蚧浸製藥酒，服後可滋陰補肺。
民間有蛤蚧藥效全在尾部，尾巴一斷便會大大降低功效的說法。據有關部門對蛤蚧的斷尾進行鑑定，未發現蛤蚧的尾巴有什麼特殊的物質，因此，尾巴一斷便會失去藥效的說法無科學依據。
民間泡蛤蚧酒的方法很多，一種是生泡，即把蛤蚧破肚去內臟、眼珠、腦髓後，把血拭淨，不用水洗便放到酒裏去泡；一種是幹浸，即將破肚去髒的蛤蚧用竹片把肢體撐開，文火拷幹，然後泡酒，這樣蛤蚧不會變質。以蛤蚧爲主料已生產的成藥有蛤蚧精、蛤蚧酒、蛤蚧補腎丸、蛤蚧三七酒等。
由於其功效卓著，貨源較缺，價格較高，因此時有不法之人採用壁虎等來假冒蛤蚧出售，使人上當受騙。真品蛤蚧的特徵是：呈扁片狀，頭頸部及軀幹部長9～18釐米，頭頸部約佔１／３，腹背部寬6～11釐米，尾長6～12釐米。
頭略呈扁三角狀，兩眼多凹陷成窟窿。兩頒緣密生細齒，無大牙。吻部半圓形，吻鱗不切鼻孔，與鼻鱗相連，上鼻鱗左右各一片，中間被額鱗隔開，上脣鱗12對，下脣鱗（包括頦鱗）21片。腹背部呈橢圓形，腹薄。
背部呈灰黑色或銀灰色，有黃白色或灰綠色斑點散在或密集成不顯的斑紋，脊椎骨及兩側肋骨突起。四足均具趾；趾間僅具蹼跡，足趾底有吸盤。尾細而堅實，微現骨節，與背部顏色相同，有7個明顯的銀灰色環帶。全身密被圓形或多角形微有光澤的細鱗。氣腥，味微鹹。
僞品蛤蚧則系以鄰科的多種動物冒充，如壁虎、疣螈、喜山鬣蜥、山溪鯢、無蹼壁虎、蠟皮蜥等，購買時要注意鑑別。
