乙肝疫苗是通过基因合成的乙型肝炎表面抗原，可以刺激机体产生表面抗体，从而对病毒有抵抗力。基因工程乙肝疫苗是一种乙型肝炎亚单位疫苗，系采用现代生物技术将乙型肝炎病毒中表达表面抗原的基因克隆进入酵母菌中，通过培养这种重组母菌来获取乙肝表面抗原亚单位，经纯化加佐剂吸附后制成的。
有些人经过化验证实为HBsAg(乙型肝炎表面抗原)阳性，伴有乙型肝炎病毒e抗原或抗HBe阳性，这时就希望能通过注射乙肝疫苗的方法使机体产生免疫力(抵抗力)，将乙型肝炎病毒消灭掉。但事实上，这种想法是行不通的。
这是因为乙肝疫苗的主要成分实际上就是乙型肝炎病毒的不具感染性的外壳(乙型肝炎表面抗原)，另外还有些免疫试剂，可以帮助刺激机体免疫系统产生抗体。对于乙型肝炎病毒感染者来讲，体内有乙型肝炎病毒在不断地复制，而且病毒在复制时，合成乙型肝炎病毒e抗原的能力特别强，因此血液中循环的乙型肝炎病毒e抗原远超过注射的乙肝疫苗中所含的乙型肝炎病毒e抗原量。所以我们可以想象，体内如此大量的乙型肝炎病毒e抗原尚不能诱导体内产生抗HBs，那么另外再给乙肝疫苗，又能起多大作用呢?因此，对已经感染了乙型肝炎病毒的人，再给予乙肝疫苗注射显然是不能起到预防乙肝的作用的。
可见，乙肝疫苗是预防感染乙肝的，已经感染了乙肝或成为乙型肝炎病毒携带者后，再注射乙肝疫苗就没有意义了。
