脑室炎的诊断主要依靠脑脊液细胞学检查，除腰椎穿刺脑脊液内白细胞增加及发现脓球外，脑室液的炎症改变亦明显，甚至可查见絮状脓性分泌物，蛋白含量增高，糖定量降低，细菌培养可为阳性。
CT扫描可见被炎症波及的脑室室管膜有局限性或弥散性薄层线状强化，脑室内粘连出现分隔状强化灶，脑积水或脑室变形、扩大。脑室室管膜炎的MRI表现，早期可无阳性改变，严重时行T2加权扫描，可见脑室周围白质内有带状高信号区环绕，脑室内的脓性灶亦显高信号。
除此之外，CT和MRI还常发现一些并发于脑室炎的病变，如脑膜炎、脑脓肿、脑水肿及软化灶等。
细菌性脑室炎的治疗与脑膜炎相似，应尽早查清致病菌及药物敏感试验，以便选用能透过血脑屏障的强效抗生素及药物，尽快投给。同时，应立即将先前置入脑室的引流管或分流管拔除，因为附着在管壁上的细菌具有更大的耐药性。
如果脑室系统没有梗阻，选用的抗菌药物有效，感染常能得以控制，随之脑脊液细胞数即减少，病情亦迅速改善。设若是脑室系统存在阻塞，或敏试有效的药物透过血脑屏障较差时，则应在全身用药的同时，反复行脑室穿刺引流，并经脑室内给药。
此时由于梗阻已变为脑室积脓（Pyocephalus），则需用置管引流或行双管冲洗引流，以4～8万u庆大霉素溶在500ml生理盐水中，由一管缓慢持续滴入，经另一管等量引流至封闭的瓶或袋中，每分钟30～40滴保持出入平衡，直到引流液转清，症状好转，细菌培养阴性及白细胞数正常之后，始可拔管。
位于脑深部接近脑室的脓肿，因靠室管膜一侧的脓壁纤维化进程较慢，往往菲薄，故有突然破入脑室引起急性化脓性脑室炎的危险。遇此情况，唯有紧急开颅切除脓肿，用抗菌盐水彻底冲洗脑室，并置管行脑室外持续引流，同时，全身加强抗菌治疗，始有一线救治希望。
