公立醫院對下直接面對患者，對上連着衛生管理部門和醫藥企業，公立醫院改革是新醫改的核心環節，被衛生部部長陳竺稱爲“最艱鉅”的任務。公立醫院改革是個複雜的工程，牽涉醫生待遇、醫療投入、醫藥體制等各種利益的調整和再分配。因此《指導意見》才姍姍來遲，甚至一度傳出“暫停”的消息。
說複雜，其實也不復雜，把公立醫院改革的目標轉化爲患者的感受，無非是有了病敢去看，看病不再難也不再貴。用《指導意見》中的話說，核心就是堅持公立醫院的“公益性”。公益的反面，就是逐利。名爲“公立”，實爲“營利”，我國公立醫院長期處於“名不副實”的尷尬境地。以提供公共醫療服務、救死扶傷爲己任的公立醫院，一旦陷入逐利深潭，各種亂象就不足爲奇。
醫療是最重要的民生大事之一，健康權無法保障，有病不敢去看，治病先談錢，掛號排隊像逃難，怎麼談得上幸福和尊嚴？其實何止是患者，如果放手逐利，受害的還有醫院和醫生。專業技術和勞動無法贏得尊重，開個方子還要琢磨怎麼掙錢，估計許多醫生自己也會覺得沒有尊嚴。
公共醫療必須重返公益性目標。新公佈的《指導意見》，主要亮點就是加大政府投入、建立公立醫院補償機制，這無疑直面了難點，抓住了重點。而改革試點一項重要內容，就是逐步取消藥品加成，斬斷以藥養醫機制，將公立醫院經濟補償渠道改爲服務收費和政府補助兩種。
原本按規定，藥品加成僅佔公立醫院收費的15%，但實際上卻要高得多。在一些已經試行藥物零差價的醫院，患者醫藥費用下降了50%左右，醫院收入則減少60%左右。也就是說，醫院不“賣藥”了，就可以大大降低醫療費用，讓老百姓得實惠，但也等於斷了醫院主要的 “財源”。因此，醫改的一大核心、可以說是最大難點就是加大政府補償力度，保障斷了以藥養醫後的醫院正常運轉，保障醫生有穩定的收入，使其把心思放在患者身上。目前，公立醫院改革剛開始試點，試點的主要目的，應該是估算出需要投入多少錢，各級財政如何分擔，如何建立科學的補償和激勵機制等。這些都是我們下一步應該緊盯的，也是衡量試點成果的重要指標。
