人工流產會對女性造成極大的生理和心理傷害，據稱，多次人流後易發生內分泌紊亂，從而月經不調。人工流產好像是在子宮內做了一次“大掃除”。但是如果每次這種手術式的“大掃除”搞得不乾淨，殘留的血肉又易引起細菌感染和多種炎症。
人流還會影響以後的懷孕和生育。
不孕：
人流術後宮頸和宮腔粘連，影響懷孕。或者因爲吸刮過度造成子宮內膜損傷，影響受精卵着牀。異位妊娠 ：即宮外孕 ，人工流產後易伴發感染，感染將帶來子宮內膜和輸卵管炎症，而子宮內膜及輸卵管炎症是造成異位妊娠的重要原因。
自然流產 率增高：
人工流產後常見的併發症爲子宮頸損傷，當再次妊娠時會由於子宮頸口功能不全而引起早產或晚期流產。圍產兒死亡率增高：有些人工流產手術由於損傷了子宮內膜肌層，造成再次妊娠時胎盤血液循環障礙，引起胎盤功能不全，以致胎兒缺氧、生長過緩、早產死胎和新生兒死亡率增高。
此外，人流尤其是婚前人流，有可能會對女性的心靈造成難以抹去的陰影。
