當女性的外生殖器出現炎症、感染時會有性交疼痛，但此時根本不應該進行性生活。在正常女性中出現性交疼痛的絕大多數原因是在女性尚未充分興奮時就急於性生活。這可以說大部分是她的性伴侶的錯。
要知道，平常女性的外生殖器是緊閉的，這樣可以防止細菌、微生物進入陰道造成感染。只有在性生活時，當女性激發起充分的性興奮時，大小陰脣大量充血、外展，陰道口外露，爲性生活作好準備。更爲關鍵的是，女性在充分的性興奮時會有大量的腺體分泌及體液“漏出”，它們充滿陰道及陰道口，它是極好的潤滑劑，它能誘導陰莖進入陰道並使得堅硬的陰莖進入陰道時不致使柔軟的陰道粘膜因強烈的磨擦而受到損傷。
如果不瞭解這一生理特點，在女性未進入充分的性興奮狀態下就急於性交，就會因爲陰道口未完全張開、陰道過於乾燥，堅硬的陰莖強行插入而造成陰道粘膜的磨擦、損傷、出現性交疼痛，嚴重的更會造成陰道撕裂、出血。在這種情況下，女性是不可能體驗到性高潮的，她們能感覺到的只能是疼痛和傷害。
初次體驗性生活的女性常常因爲過於緊張而難以達到足夠的性興奮，換句話說，她的陰道往往並沒有爲性生活做好充分準備，甚至一些女性會因爲對性交的恐懼而出現陰道痙攣。如果她的性伴侶也是經驗不足的話，就很容易因爲陰莖的強行插入而造成陰道粘膜的磨擦、損傷出現疼痛。
一般來說，經過一定次數的性生活體驗、積累了一定的性生活經驗後這種情況就會改善或消失。如果有較多性生活經驗，仍然在每次性生活都覺得疼痛的話就要考慮其它原因了。
少數的女性性交疼痛即可能是由於處女膜堅韌或閉鎖，或外傷、手術、分娩後形成疤痕，陰道縮窄。極少數是由於先天陰道畸型、無陰道等而引起的。而現代醫學在治療上述的病例時可以說易如反掌，只需做簡單的疤痕鬆解、手術整形、或陰道成型等手術就可以徹底解決了，這些手術只能說是普通手術。所以，如果你不幸有這種情況，不要害怕面對醫生。
更少數的女性由於恥骨解剖學上的變異，恥骨邊緣銳利，在特定的性交體位時會出現性交疼痛。此時，就要避免進行這種體位性交了。
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