各種先天性畸形，如先天性椎體融合、顱底凹陷等情況都易於誘導頸椎病的發生，這也是頸椎病的發病因素之一。
在對正常人頸椎進行健康檢查或作對比研究性攝片時，常發現頸椎段可有各種異常所見，其中骨骼明顯畸形約佔5%。與頸椎病患者對比，後者頸椎的畸形數約爲正常人的一倍以上。此說明骨骼的變異與頸椎病的發生有着一定關係。在臨牀上較爲多見且與頸椎病發病相關性較大的畸形主要有以下五種：
以頸2～3和頸3～4最爲多見，其次爲頸4～5，多爲雙節融爲一體，三節融合者罕見，間隔一節或二節形成雙節雙融合者亦少見。
由於椎體融合，兩個椎體之間的椎間關節原有的活動量勢必轉移至相鄰的上下椎節。按照頸椎的生物力學特點，當頸3～4以上椎節先天融合時，其下一椎節由於負荷增加而使該節的退變明顯加劇，甚至出現損傷性關節炎，如同時伴有椎管發育性狹窄，則其發病時間更早。而椎管寬大者，或是靠近上頸椎者，其發病則較遲。
