附睾具有以下主要生理功能。
1、貯存精子
精子進入附睾後，一般要逗留大19－25天，精子到達附睾尾，如未能及時排出，則先貯存於尾部。由於附睾管腔內的特殊環境，其液體性質偏酸，滲透壓非常高，氧含量低、二氧化碳含量高，使精子處於靜息狀態，以便貯積能量。精子在附睾尾部可存活28天或更久。
2、分泌營養物質，促使精子成熟
附睾分泌功能很強，能分泌甘油磷酸膽鹼、肉毒鹼、糖蛋白及多種酶，這些物質與精子的代謝、成熟和正常生理功能有關。精子在附睾管內決不是單純地停留、路過，而是在漫長的旅途中，不斷吸收附睾管壁分泌的營養物質，如肉毒鹼等，繼續發育直到成熟狀態。附睾中肉毒鹼的濃度可爲血液中的500倍。動物實驗表明，如果去除附睾管，把輸精管直接與睾丸輸出小管吻合，經輸精管排出的精子不具備受精能力。如果把輸精管與附睾始端的1釐米左右處吻合，則排出的精子具有活力和受精能力。這就說明附睾管頭部對精子成熟來說是絕對必要的。附睾管分泌的甘油磷酸膽鹼與維持附睾尾部的高滲微環境有關，同時也可作爲精子在女性生殖道內的能源，因女性生殖道內有一種酶，可將甘油磷酸膽鹼分解成乳酸和果糖。
3、免疫屏障作用
附睾本身有一種屏障作用，它可以防止精子進入附睾上皮內，以免發生自身免疫反應。輸精管結紮後，這種屏障有可能遭到破壞，於是精子表面的特殊大分子物質（抗原）與機體內的免疫系統相接觸，就會發生輸精管結紮術後的副反應－－精子抗原的自身免疫反應。簡單地說，就是體內產生一種物質（免疫球蛋白或叫抗體），能起到抑制精子活動或殺死精子的作用。#p#副標題#e#
4、吸收功能
睾丸的支持細胞每天能產生大量睾網液，如一隻公羊每天約能分泌40毫升睾網液，而從附睾排出的只不過幾百微升，也就是說睾丸分泌液有９９％被附睾上皮重新吸收回體內。動物實驗表明，結紮輸精管時睾丸不會腫脹，但若結紮睾丸輸出小管，睾丸第二天就會腫脹，這就充分證實了附睾存在着強有力的吸收功能，可是重新吸收的意義尚不清楚。
5、降解和吸收未射出的精子
附睾中具有吞噬細胞，可以使未射出的精子逐步解體和吸收。
總之，目前對精子在附睾內運行過程中的一系列重要變化的細節和確切意義尚不完全瞭解。但人們已認識到部分不育症患者的精子活力很差或爲死精子，可能與附睾的功能障礙有關。科學家們期待着早日揭開精子成熟之謎，以便找到干擾精子成熟過程的方法。附睾頭部是當前公認的最理想的抗精子成熟藥物的作用部位，因藥物作用於這裏起效快，停藥後恢復生育力也快，更重要的是副作用小，不影響睾丸功能，因而對男性正常生理活動的干擾也就會很小。
6、收縮功能
睾丸輸出小管和附睾管的自發性有節律的收縮，可把精子運向輸精管，當然其中也包括睾網液流速和附睾管腔壓力的作用。頻繁射精時，會使附睾管壁肌肉處於疲勞狀態，從而使收縮功能受到影響，導致精子減少。
7、分泌功能
附睾液中雄激素含量很高，除來自血循環和睾丸分泌的睾網液體，最近的研究發現，附睾上皮本身也能分泌少量雄激素。
