較常見的水痘併發症有以下幾種。
(一)水痘腦炎
約1000～10,000個病例中有1例發生腦炎。多發生在病程第3～8天，少數見於出疹前2周或出疹後3周。病情輕重不一，症狀和腦脊液所見與一般病毒性腦炎相仿 ，病死率爲5%～25%。其他少見的神經系統併發症有橫斷性脊髓炎、周圍神經炎、視神經炎等。
(二)繼發性細菌性感染
包括局部皮疹化膿性繼發感染、蜂窩組織炎、急性淋巴結炎、丹毒、敗血症等。
近年來美國報道水痘患兒併發甲組鏈球菌感染(Invasive Group A streptococcus GAS)，多發生於出水痘的第3～6天時，可表現爲局部紅腫的蜂窩組織炎，或者鏈球菌中毒性休克樣綜合徵(Streptococcal toxic shock-like syndrome ISLS)，均病情危重，病死率較高，需特別注意及時採取防治的措施。
(三)原發性水痘肺炎
多見於成人水痘患者和免疫受損者。輕者可無症狀，或只有乾咳，重者有咯血、胸痛、氣急、紫紺和發熱等。嚴重者可致命，尤其在妊娠中後期感染危險性更大。體徵不明顯。肺炎症狀多見於出疹後2～6天，亦可見於出疹前或出疹後10天。診斷主要依靠X線檢查，憑X線診斷有謂成人水痘中16%併發水痘肺炎，而有肺炎症狀者只佔4%。
(四)其他
水痘與Reye綜合徵常發生於水痘後期，伴嘔吐、不安和激惹，進展到腦水腫，腦部的病理改變與高氨有關，由於阿司匹林也被認爲與Reye綜合徵有關，因此國外認爲水痘感染時最好禁用阿司匹林退熱。心肌炎、腎炎、關節炎、肝炎等均少見。
