發燒是艾滋病感染者/患者發生最多的症狀，因爲人體的免疫功能降低不能抵禦各種機會性病原菌，艾滋病患者的各個器官細菌、病毒、真菌、原蟲感染都會出現，而有感染就會有發燒，那麼艾滋病發燒如何治療？如何選擇抗菌藥？
從事艾滋病臨牀治療的醫生總結出了艾滋病發燒治療經驗，艾滋病患者由於免疫功能低下，往往起病隱匿，在不同階段會感染不同病原體，而且病程漫長，有一定耐受，有56.79%的患者長期反覆發熱。
艾滋病發燒呼吸系統和消化系統感染較爲多見。艾滋病患者由於主要是細胞免疫功能低下或缺陷，相對而言與外界相通的呼吸、消化系統的屏障功能最易被破壞，病原體也更容易侵犯。從我們的分析看，咳嗽、消瘦、乏力、納差、咯痰、氣急、腹瀉等是艾滋病患者的主要症狀，因此發熱原因首先要注重在呼吸、消化系統查找，以免勞而無功。
艾滋病機會性感染是多種多樣的，多種病原體可以侵犯艾滋病患者，再加上往往由吸毒、性行爲而感染，併發症、合併症多，部分甚至隱瞞病史，經常使患者的病情呈現出幾不像——不像細菌感染、不像結核感染、不像病毒感染、不像真菌感染、不像腫瘤、不像內分泌疾病等，使得醫師很茫然。我們分析發現，機會感染主要是：口腔真菌感染、肺結核感染、肺部感染。因此醫師要爲艾滋病患者進行全面體檢，儘可能找到最可能的感染依據及部位，進行下一步處置。
臨牀醫生在診治艾滋病發熱的患者時，要仔細詢問病史全面檢查，多部位、多病原體、反覆多次地送檢標本進行病原體的培養及藥敏實驗，儘可能明確病原體及敏感藥物，指導臨牀使用抗菌藥物。從病原學考慮，真菌、結核桿菌、普通細菌都可導致發燒。醫生要明確病因不要經驗性地按照感染用藥。
另外，臨牀醫生還要根據艾滋病發燒仔細選擇抗菌藥，要根據病程、病期、既往病史及用藥史、細菌培養及藥敏結果等準確使用抗菌藥物，該單用就單用，該聯合就聯合，千萬不能輪番使用甚至眉毛鬍子一把抓什麼都用，不僅浪費資源，增加毒副反應，而且特別容易導致細菌的耐藥。
艾滋病機會性感染的病因相當不好找，而這些感染都有引起發燒的可能性，單純使用退燒藥是不行的，隨意使用抗菌藥也不行。艾滋病患者的免疫功能本就不好，再隨意用藥會加重他們的身體負擔，會使病情加重。因此找出病因選擇合適的抗菌藥纔是比較好的辦法。
