1、藥物的副作用。一般藥物具有多種藥理作用，其中有的用於治療目的，其餘的作用便成爲副作用。
副作用是指在正常劑量下，伴隨藥物的治療作用而同時發生的非治療所需的藥理作用，屬於藥物的固有效應。例如在應用β-受體阻滯劑心得安，具有β1-和β2-兩種受體的抑制作用。治療高血壓、心絞痛和心律失常時，是阻斷了心臟的β2-受體，而誘發或加重支氣管哮喘症狀，是因爲阻斷了支氣管上的β1-受體所致。
2、藥物的毒性作用。大多數藥物都有一定的毒性，有的可引起組織或器官的生理功能和結構的改變，如心臟、肝臟、腎臟、中樞神經系統、造血系統的變化。
對藥物高度在體內停留時間較長，長期服藥者可造成藥物在體內蓄積，可出現慢性毒性反應。
毒性反應往往與劑量有關，增加藥物劑量則毒性作用亦增強。因此，企圖用加大藥物劑量的方法，來增加藥物療效，其效果是有限的，有時，後果是極其危險的。
3、藥物的後繼反應(或稱後作用)。指停藥後相繼發生的生物效應。如長期應用腎上腺糖皮質激素，由於負反饋作用致腎上腺皮質功能低下。
4、變態反應。指藥物作用於機體產生的超敏感的免疫反應。
如應用青黴素及某些生物後出現的蕁麻疹、藥物熱、血管神經性水腫、休克等變態反應。
5、特異質反應。指少數人體內缺少某些代謝酶而導致服藥後出現的毒性反應。
如葡萄糖-6-磷酸脫氫酶缺乏的患者，服用磺胺類、阿司匹林、抗瘧藥(伯氨喹)等藥物後，引起急性溶血反應。
6、抗菌藥物引起的二重感染。
長期大劑量應用抗生素大量殺滅體內敏感菌，使正常菌羣失調，造成體內耐藥菌和真菌大量繁殖，形成的二重感染，如僞膜性腸炎及真菌感染等。
