一般情況下通過調理仍不能改善睡眠時，才考慮藥物治療。
選擇藥物時注意以下三點：
第一，先採用不良反應少的中成藥----常用的有七葉神安，棗仁安神、安心補腦等中成藥，也可找有經驗的中藥師開方劑煎服。
第二，如果上述措施仍不能糾正失眠，再考慮西藥治療。
應首選對中樞神經系統無抑制作用或抑制較輕、不鬆弛骨骼肌的藥物，從小劑量開始嘗試。可選擇的藥物包括丁螺環酮、唑吡坦等。這些藥物也應在醫生指導下使用，因爲隨着藥物劑量增加，其對神經系統的抑制作用和對肌肉的不良反應也會出現。
安定類藥物雖然具有確切的鎮靜作用，但也會抑制中樞神經系統，如抑制呼吸、鬆弛骨骼肌等，可能加重呼吸困難，誘發心動過緩、血壓下降、心力衰竭等。心肺功能不好時，心臟的泵血功能和肺部氧氣交換功能降低，所以，上述患者或老年人一旦失眠，對於藥物的選擇、劑量的使用更要慎重，尤其要謹慎使用安定類安眠藥物。長期服用安定類藥物者，藥物療效降低後容易產生依賴、成癮，一次大量服用就會造成昏迷和呼吸停止，釀成嚴重的不良後果。
第三，患者不要擅自聯合使用中西藥。
比如溴製劑與含硃砂的安神丸、鎮靜丸合用，會在體內形成有毒的溴化汞，可引起嚴重的不良反應。此外，經常打鼾的患者，特別是因肥胖患有呼吸睡眠暫停綜合徵的患者，如果合併失眠，需要用藥治療時，也應按照上述方案選擇藥物，以避免不良後果。
