I型前列腺炎的抗生素治療時必要而緊迫的。一旦得到臨牀診斷或血、尿培養結果後，應立即應用抗生素。推薦開始時經靜脈應用抗生素，待患者的發熱等症狀改善後，推薦使用口服藥物，療程至少4周。
急性細菌性前列腺炎伴尿瀦留者可採用恥骨上膀胱穿刺造口引流尿液，也可採用細導管導尿，但留置尿管時間不宜超過12h。伴膿腫形成者可採取經直腸超聲引導下細針穿刺引流、經尿道切開前列腺膿腫引流或經會陰穿刺引流。
II型和III型前列腺炎(慢性前列腺炎)的治療目標主要是緩解疼痛。健康教心理和行爲輔導有積極作用。患者應該戒酒，忌辛辣刺激食物;避免憋尿、久坐，注意保暖，加強體育鍛煉。最常用的藥物是抗生素、α受體阻滯藥、植物藥和非甾體抗炎鎮痛藥，其他藥物對緩解症狀也有不同程度的療效。
①抗生素：目前，在治療前列腺炎的臨牀實踐中，最常用的一線藥物是抗生素，但是隻有5%的慢性前列腺炎患者有明確的細菌感染。 II型前列腺炎要根據細菌培養結果和藥物穿透前列腺的能力來選擇抗生素。前列腺炎確診後，抗生素治療的療程爲4~6周，其間應對患者進行階段性的療效評價。不推薦前列腺炎內注射抗生素的治療方法。IIIA型前列腺炎的抗生素治療大多爲經驗型治療，理論上推測，是某些常規培養陰性的病原體導致了該型炎症的發生。因此，推薦先口服氟喹諾酮等抗生素2~4周，然後根據療效反饋決定是否繼續抗生素治療。只在臨牀症狀確有減輕時才建議繼續應用抗生素。推薦的總療程爲4~6周。IIIB型前列腺炎不推薦使用抗生素。
②α受體阻滯藥：α受體阻滯藥能鬆弛前列腺和膀胱等部位的平滑肌而改善下尿路症狀和疼痛，因而成爲治療II型/III型前列腺炎的基本藥物。可根據患者的情況選擇不同的α受體阻滯藥。推薦使用的α受體阻滯藥主要有：多沙唑嗪、萘哌地爾、坦索羅辛和特拉唑嗪等，對照研究結果顯示上述藥物對患者的排尿症狀、疼痛及生活質量指數等有不同程度的改善。
