阴茎的大小主要是受遗传因素的影响，真性男性阴茎短小症是多见于先天性，少数为后天的。先天症的有睾丸发育不全症又称克氏综合症。
从美国性医学专家的统计来看，拥有短一点阴茎的男子，性能力不弱反强。
假如阴茎长，那么要让其性能力保持较强状态，它就必须比较厚实，这样才能坚挺。但可惜的是，统计显示，较长的阴茎大多不够厚实，所以也就不够硬挺。即便阴茎长且硬，也容易在猛烈的性生活中出现折断或弯曲的问题，增加男性性安全隐患，同样影响快感。
若阴茎较短，一般就会较粗，从而增加了性生活的安全性，此外因为较短所以海绵体供血更充分，所以一般硬度会更佳，并且，因为男性感受性交快感的神经主要分布在阴茎头部冠状沟远端2—3厘米的范围内，而女性阴道的感觉神经末梢主要分布在外1/3部分，内2/3部分几乎感觉不到性快感，所以，阴茎较短反而更有利。国内的调查认为，我国男性青壮年阴茎勃起后的长度多在10—19厘米范围内。
阴茎大小不会与身高或体重成正比，常态下阴茎体积较小的男性，勃起后长度反而可以增加许多，大多能满足正常性生活的要求。所以，阴茎大小不足以成为决定性生活美满程度的标志。有人担忧阴茎较短会影响性能力，就胡乱服用性激素或中药，这样不仅无助于增大阴茎，还可能由此造成很多严重副作用，研究表明一般充分勃起后阴茎长度大于8厘米即可正常完成性交，及生儿育女。
