1.触摸法
2.探针检查
3.注入染色剂
4.灌注双氧水
双氧水灌注法适应各种瘘、尤其是高位 复杂的。
方法：在喇叭型肛门镜下在直肠内齿线上方塞3到4个干棉球，防止双氧水流入直肠腔烧灼肠黏膜。将装有双氧水的针管接上一细塑料管插入肛瘘外口，将外口用纱布适度压紧，从外口向管道内缓慢推注，在肛镜下可见白色泡沫从内口流出介入法对复杂性难治性肛瘘诊断也很重要。
5.索罗门规则
6.介入法低位切开高位乳胶管引流法/双氧水灌注法。
有以下两种常用检查：
①碘油检查(检查前清洁肠道，在X线的指引下，从外口缓慢注入造影剂，然后在透视下，从不同位置进行观察和摄片。)
②超声 复杂性难治性肛瘘超声可以准确的诊断和有效的治疗。传统的外科手术容易形成肛瘘，超声能准确地确定肛周围脓肿的部位、大小、轮廓、形态以及与周围组织的关系，同时可以确定脓肿是否完全液化，不仅如些，超声可以准确地确定穿刺部位，进针方向和角度以及深度。从而完全、彻底、干净地引流。
