肛周膿腫的主要症狀是肛門直腸周圍腫脹、疼痛，體徵表現爲肛門直腸周圍紅腫，觸及硬結、壓痛。根據肛周膿腫的發生位置不同，臨牀有以下分類：
1、直腸粘膜下膿腫
局部症狀輕，全身症狀重。直腸鏡下可見直腸粘膜明顯的限局性腫脹、發紅。直腸指診可摸到直腸壁上有限局性柔軟腫塊，壓痛、波動，穿刺可抽出膿汁。
2、直腸後間隙膿腫
肛外正常，疼痛可向臀部放射，可出現發熱、周身不適等全身中毒症狀。可觸及直腸後壁腫脹、壓痛及波動感。
3、骨盆直腸窩膿腫
局部症狀不明顯而全身症狀較重。感覺直腸、肛門沉重下墜，頻有便意，大便時加重，排尿困難。全身表現爲發熱、周身疲倦，嚴重者有毒血癥的症狀，如頭痛、高熱、嘔吐、大汗出。局部可見直腸粘膜隆起，在提肛肌上可觸及腫塊、壓痛、波動。
4、坐骨直腸窩膿腫
局部與全身症狀都比較明顯，肛緣外一側或兩側紅腫，壓痛或有波動，全身表現爲感染症狀。
5、肛門周圍皮下膿腫
全身症狀輕，可有發熱、全身不適感，局部疼痛。
6、肛門後間隙膿腫
局部疼痛，可見肛門後側紅腫，全身症狀輕。
7、肛管粘膜下膿腫
發生在齒線附近，局部疼痛、腫脹、壓痛、肛門鬆弛，粘膜下膿腫常與皮下膿腫相通。
8、馬蹄形膿腫
又分爲半馬蹄形膿腫和全馬蹄形膿腫，多爲坐骨直腸窩膿腫遷延治療發展而成，表現特點與坐骨直腸窩膿腫相似。
9、括約肌間膿腫
發生在內外括約肌之間，局部疼痛、腫脹、壓痛，肛門鬆弛。
肛周膿腫有癌變危險
肛周膿腫的多發性，可形成直腸陰道膿腫、直腸尿道膿腫和直腸膀胱膿腫，危及周圍臟器，並且多年未治或誤治的老肛周膿腫有癌變的可能。肛周膿腫若治療不及時，可使低位膿腫感染加重、蔓延擴散，轉化成高位膿腫。假如耽誤治療，也會造成膿腫範圍的擴大、部位增多，給患者造成更大的痛苦，給治療造成更大的難度。
