1.觸摸法
2.探針檢查
3.注入染色劑
4.灌注雙氧水
雙氧水灌注法適應各種瘻、尤其是高位 複雜的。
方法：在喇叭型肛門鏡下在直腸內齒線上方塞3到4個幹棉球，防止雙氧水流入直腸腔燒灼腸黏膜。將裝有雙氧水的針管接上一細塑料管插入肛瘻外口，將外口用紗布適度壓緊，從外口向管道內緩慢推注，在肛鏡下可見白色泡沫從內口流出介入法對複雜性難治性肛瘻診斷也很重要。
5.索羅門規則
6.介入法低位切開高位乳膠管引流法/雙氧水灌注法。
有以下兩種常用檢查：
①碘油檢查(檢查前清潔腸道，在X線的指引下，從外口緩慢注入造影劑，然後在透視下，從不同位置進行觀察和攝片。)
②超聲 複雜性難治性肛瘻超聲可以準確的診斷和有效的治療。傳統的外科手術容易形成肛瘻，超聲能準確地確定肛周圍膿腫的部位、大小、輪廓、形態以及與周圍組織的關係，同時可以確定膿腫是否完全液化，不僅如些，超聲可以準確地確定穿刺部位，進針方向和角度以及深度。從而完全、徹底、乾淨地引流。
