一、鼻咽鏡檢查
有間接鼻咽經和纖維鼻咽鏡兩種。檢查時可見到鼻咽粘膜充血，輕度糜爛、潰爛、粘膜粗糙、變色、水腫、或鼻咽壁隆起，不對稱等。如鼻咽後壁與軟齶背面間距狹小，爲癌組織侵入後壁的粘膜下組織；如一側咽隱窩狹窄或消失，兩側不對稱，提示腫瘤侵入咽旁間隙或動脈鞘區。原發竈較小時，鏡檢查不易發現。
二、病理檢查
1．組織細胞學檢查 經鼻腔或口腔，鉗取可疑組織送病理，如活檢結果爲陰性，但臨牀仍覺可疑者，可反覆多次活檢並隨診觀察。
2．脫落細胞學檢查 取鼻咽活體組織檢查的同時配合合作脫落細胞學檢查，可補充活檢之不足。特別對病竈小，活檢困難或初次活檢爲陰性者，
3．頸淋巴結穿刺或頸淋巴結摘除活檢 對腫大之頸淋巴結、質硬、活動差而鼻咽癌未發現明顯可疑病變者，對頸部腫大之淋巴結可作細針穿刺活檢或切除活檢，但其活檢疤痕將影響放射治療療效。
三、前鼻鏡檢查
少數病例可發現新生物侵入後鼻孔，多呈肉芽組織狀。
四、X線檢查
通過X線片檢查，可以瞭解到腫瘤範圍和顱底骨質破壞情況，有利於對鼻咽癌的分期指定放射治療計劃，評價預後等。根據具體情況可攝鼻咽部側位片、顱底片。
1、顱底片 能顯示顱中窩的結構，包括鼻中隔、鼻腔、蝶竇、翼板、破裂孔、巖骨、枕骨斜坡棘孔、卵圓孔等。
2、鼻咽側位片 能顯示鼻咽頂壁、後壁、口咽後壁的軟組織厚度、粘膜表面形態、氣道有無狹窄和篩竇、蝶竇、蝶鞍、翼齶窩等有無骨質破壞。
鼻咽癌早期在鼻咽癌側位片和顱底片上往往顯示不清，隨着病竈的增大可見結節隆起、巨大腫塊或僅爲鼻咽軟組織增厚。顱底骨質破壞時，腫瘤浸潤處只要表現爲溶滑性缺損或正常孔道的擴大，邊緣不規則等。在兩側對比時可呈現不對稱的現象。普通X線對早型、混合型和囊狀擴張型等。骨轉移常爲多發性。
五、CT掃描檢查
CT具有較高的分辨率，不僅能顯示鼻咽部表層結構的改變，還能較清楚地顯示顱底骨質情況及鼻咽部、鼻咽旁腫瘤侵犯情況，以便能全面瞭解腫瘤範圍及進行準確的分期爲更好地作出放射治療設計提供幫助。
六、B病毒血清學檢測
EB病毒LgA抗體(VCA-LgA抗體)及DNA酶活性的檢測，作爲鼻咽癌的輔助診斷方法，已被臨牀廣泛應用，若滴定度高時應警惕鼻咽癌的可能。對鼻咽癌的高危人羣，可作定期檢查，有助早期發現和早期診斷的價值。
七、RI檢查
對軟組織的分辨率較CT高，可以確定腫瘤的部位、範圍及對鄰近結構的侵犯情況，可鑑別放療後組織纖維化和復發的腫瘤。鼻咽癌在T1加權像呈中等、較低信號、T2加權像信號增高，增強後可見病竈實質部分強化。骨質破壞時，受累區表現爲中、低信號。
