在門診經常碰到有些疑有性病的患者，因怕受歧視、怕暴露隱私等不敢到正規醫院治療而是採取自我診斷、自行治療的方法，結果往往造成誤診，或用藥不當，治療不徹底等，不僅沒有治好病，反而對身體健康造成了危害。有人因此而延誤了治療，有人把不是性病的病也當成性病胡亂長期用藥，當了冤大頭。
例如某一衣原體感染者自己查書買藥吃，花了幾千元仍然不好，後去醫院檢查，雖然衣原體感染已被控制，但又造成了龜頭念珠菌感染;某尖銳溼疣患者自行用藥造成了局部潰爛;某性病患者自我診斷得了“軟下疳”，自己買磺胺藥服，結果越治越重，後到醫院檢查發現是磺胺藥引起的藥疹等等。
在某些病人心裏認爲性病“治療簡單，用點抗生素就行了”，實際上性病與其他傳染病一樣，必須由專業醫生治療。曾有二期梅毒病人，在鄉醫生處用水劑青黴素肌內注射治療，結果造成了轉爲潛伏梅毒的病例。還有的病人由於低劑量的不規則用藥產生耐藥菌株，降低了治療效果。
以淋病爲例，我國有些地區的耐青黴素菌株已達50%一70%以上，近來還不斷產生新的耐藥菌株，結果打了不少青黴素也沒有起到相應的治療作用，反給治療增加了許多困難。
據全國性病麻風病控制中心1999年疫情報告，全國胎傳梅毒、晚期梅毒病例增幅較大，爲99.3%和94.1%，其中一個重要因素就是患者未接受規範化的治療，結果傳染子女或轉成慢性/隱性感染。
